Os mananciais são todas as fontes naturais de onde é retirada água para o consumo. Estes reservatórios devem estar bem conservados para garantir que o abastecimento das cidades sem comprometer o meio ambiente. Um dos aspectos que afetam os mananciais é a falta de conservação dos solos, pois passa a permitir o escoamento de todos os resíduos presentes nas áreas próximas aos cursos d’água causando o assoreamento.

Uma das formas de se comprometer os mananciais é possibilitar que parte de nutrientes, como os agrotóxicos, entrem em contato com a água limpa. Nas periferias das grandes cidades e também na zona rural onde se cultiva hortaliças costuma ser freqüente o uso de agrotóxicos. Outra intervenção humana que acarreta problema se não feita de forma responsável é a extração mineral. Essa atividade tem gerado problemas ambientais dos mais diversos aos mananciais do Cerrado. A ação extrativista descontrolada provoca assoreamentos e descaracteriza o leito dos rios, desbarrancando as margens.